Karbapeneemiresistentin Hypervin kliiniset ja molekyyliset ominaisuudet

Javascript on tällä hetkellä poissa käytöstä selaimessasi.Kun javascript on poistettu käytöstä, jotkin tämän sivuston toiminnot eivät toimi.
Rekisteröi tarkat tietosi ja kiinnostavat lääkkeet, niin yhdistämme antamasi tiedot laajan tietokantamme artikkeleihin ja lähetämme sinulle PDF-kopion sähköpostitse oikea-aikaisesti.
Karbapeneemille resistentin korkean virulenssin Klebsiella pneumoniaen kliiniset ja molekyyliset ominaisuudet korkea-asteen sairaalassa Shanghaissa
Zhou Cong, 1 Wu Qiang, 1 He Leqi, 1 Zhang Hui, 1 Xu Maosuo, 1 Bao Yuyuan, 2 Jin Zhi, 3 Fang Shen 11 Kliinisen laboratorion lääketieteen osasto, Shanghain viides kansansairaala, Fudanin yliopisto, Shanghai, Kansantasavalta Kiina;2 Shanghai Jiaotong Laboratory Medicine -osasto, Shanghai Children's Hospital, Shanghai, Kiinan kansantasavalta;3 Neurologian osasto, Shanghain viides kansansairaala, Fudanin yliopisto Vastaava kirjoittaja: Fang Shen, Kliinisen laboratoriolääketieteen osasto, Shanghain viides kansansairaala, Fudanin yliopisto, nro 128 Ruili Road, Minhangin alue, Shanghai, postinumero 200240, ChinaPuhelin +86 1802110733 Sähköposti [sähköposti suojattu] Tausta: Karbapeneemiresistenssin ja hypervirulenssin fuusio Klebsiella pneumoniaessa on johtanut suuriin kansanterveyshaasteisiin.Viime vuosina on tullut yhä enemmän raportteja karbapeneemeille resistenteistä korkeavirulenssisista Klebsiella pneumoniae (CR-hvKP) -isolaateista.Materiaalit ja menetelmät: Retrospektiivinen analyysi CR-hvKP-tartunnan saaneiden potilaiden kliinisen tiedon arvioinnista tammikuusta 2019 joulukuuhun 2020 korkea-asteen sairaalassa.Laske 2 vuoden sisällä kerätyt Klebsiella pneumoniae, Klebsiella pneumoniae (hmKP), karbapeneemille resistentti Klebsiella pneumoniae (CR-hmKP) ja karbapeneemille resistentti korkeavirulenssikeuhkokuume. Leberellan (CR-hvKP) isolaattien lukumäärä.Resistenssigeenien, virulenssiin liittyvien geenien, kapseliserotyyppigeenien ja CR-hvKP-isolaattien monilokussekvenssityypityksen (MLST) PCR-detektio.Tulokset: Tutkimuksen aikana eristettiin yhteensä 1081 ei-toistuvaa Klebsiella pneumoniae -kantaa.Mukaan lukien 392 Klebsiella pneumoniae -kantaa (36,3 %), 39 CR-hmKP-kantaa (3,6 %) ja 16 CR-hvKP-kantaa (1,5 %).Noin 31,2 % (5/16) CR-hvKP:sta eristetään vuonna 2019 ja noin 68,8 % (11/16) CR-hvKP:sta vuonna 2020. 16 CR-hvKP-kannasta 13 kantaa ovat ST11 ja serotyyppi K64, yksi kanta on serotyyppejä ST11 ja K47, yksi kanta on ST23- ja K1-serotyyppejä ja yksi kanta on ST86- ja K2-serotyyppejä.Virulenssiin liittyvät geenit entB, fimH, rmpA2, iutA ja iucA ovat läsnä kaikissa 16 CR-hvKP-isolaatissa, joita seuraavat mrkD (n=14), rmpA (n=13), aerobaktiini (n=2) , AllS ( n = 1).Kaikki 16 CR-hvKP-isolaattia kantavat karbapenemaasigeenin blaKPC-2 ja laajennetun spektrin β-laktamaasigeenin blaSHV.ERIC-PCR-DNA-sormenjälkien tulokset osoittivat, että 16 CR-hvKP-kantaa olivat erittäin polymorfisia, ja kunkin kannan juovat olivat merkittävästi erilaisia, mikä osoitti satunnaista tilaa.Johtopäätös: Vaikka CR-hvKP:ta levitetään satunnaisesti, se kasvaa vuosi vuodelta.vuosi.Siksi kliinistä huomiota tulee herättää ja tarvittaviin toimenpiteisiin tulisi ryhtyä superbakteerin CR-hvKP:n kloonauksen ja leviämisen välttämiseksi.Avainsanat: Klebsiella pneumoniae, karbapeneemiresistenssi, korkea virulenssi, runsaasti limaa, epidemiologia
Klebsiella pneumoniae on opportunistinen patogeeni, joka voi aiheuttaa erilaisia ​​infektioita, mukaan lukien keuhkokuume, virtsatieinfektiot, bakteremia ja aivokalvontulehdus.1 Viimeisten kolmenkymmenen vuoden aikana, toisin kuin klassinen Klebsiella pneumoniae (cKP), uudesta erittäin virulentista Klebsiella pneumoniae (hvKP) -limakalvon limasta on tullut kliinisesti tärkeä taudinaiheuttaja, joka löytyy erittäin aggressiivisia infektioita, kuten maksan paiseita, aiheuttavat terveillä. ja immuunipuutteisille henkilöille.2 On syytä huomata, että näihin infektioihin liittyy yleensä tuhoisia leviäviä infektioita, mukaan lukien endoftalmiitti ja aivokalvontulehdus.3 Korkean limakalvon limakalvofenotyypin hvKP:n tuotanto johtuu yleensä lisääntyneestä kapselipolysakkaridien tuotannosta ja spesifisten virulenssigeenien, kuten rmpA ja rmpA2.4, läsnäolosta.Korkean liman fenotyyppi määritetään yleensä "jonotestillä".Yön yli veri-agar-maljoilla kasvatettuja Klebsiella pneumoniae -pesäkkeitä venytetään silmukalla.Kun muodostuu viskoosi köysi, jonka pituus on >5 mm, "köysitesti" on positiivinen.5 Tuore tutkimus osoitti, että peg-344, iroB, iucA, rmpA rmpA2 ja rmpA2 ovat biomarkkereita, jotka voivat tunnistaa hvkp:n tarkasti.6 Tässä tutkimuksessa erittäin virulentilla Klebsiella pneumoniaella määriteltiin olevan erittäin liman viskoosinen fenotyyppi (positiivinen string-testitulos) ja se kantaa Klebsiella pneumoniae -virulenssiplasmidiin liittyviä kohtia (rmpA2, iutA, iucA). 1980-luvulla Taiwanin tapausraportit kuvasivat ensimmäisen kerran yhteisön - hvKP:n aiheuttamat hankitut maksapaiseet, joihin liittyy vakavia pääteelinten vaurioita, kuten aivokalvontulehdus ja endoftalmiitti.7,8 hvKP:lla on satunnainen leviäminen monissa Aasian, Euroopan ja Amerikan maissa.Vaikka Euroopassa ja Amerikassa on raportoitu useita hvKP-tapauksia, hvKP:n esiintyvyys esiintyi pääasiassa Aasian maissa, erityisesti Kiinassa.9
Yleensä hvKP on herkempi antibiooteille, kun taas karbapeneemille resistentti Klebsiella-keuhkokuume (CRKP) on vähemmän myrkyllinen.Kuitenkin lääkeresistenssi- ja virulenssiplasmidien leviämisen myötä CR-hvKP:n kuvasivat ensin Zhang et ai.vuonna 2015, ja kotimaisia ​​raportteja tulee yhä enemmän.10 Koska CR-hvKP voi aiheuttaa vakavia ja vaikeasti hoidettavia infektioita, pandemian kloonin ilmaantuessa siitä voi tulla seuraava "superbugi".Tähän mennessä useimmat CR-hvKP:n aiheuttamat infektiot ovat esiintyneet satunnaisesti, ja pienimuotoiset taudinpurkaukset ovat harvinaisia.11,12
Tällä hetkellä CR-hvKP:n havaitsemisaste on alhainen, ja siihen liittyviä tutkimuksia on vähän.CR-hvKP:n molekyyliepidemiologia on erilainen eri alueilla, joten on tarpeen tutkia CR-hvKP:n kliinistä jakautumista ja molekyyliepidemiologisia ominaisuuksia tällä alueella.Tässä tutkimuksessa analysoitiin kattavasti CR-hvKP:n resistenssigeenit, virulenssiin liittyvät geenit ja MLST.Yritimme tutkia CR-hvKP:n esiintyvyyttä ja molekyyliepidemiologiaa korkea-asteen sairaalassa Shanghaissa, Itä-Kiinassa.Tällä tutkimuksella on suuri merkitys CR-hvKP:n molekyyliepidemiologian ymmärtämiselle Shanghaissa.
Fudanin yliopistoon kuuluvan Shanghain viidennen kansansairaalan ei-toistuvat Klebsiella pneumoniae -isolaatit tammikuusta 2019 joulukuuhun 2020 kerättiin takautuvasti ja laskettiin hmKP:n, CRKP:n, CR-hmkp:n ja CR-hvKP:n prosenttiosuudet.Kaikki isolaatit tunnistettiin kompaktilla automaattisella VITEK-2 mikrobianalysaattorilla (Biomerieux, Marcy L'Etoile, Ranska).Maldi-Tof-massaspektrometriaa (Bruker Daltonics, Billerica, MA, USA) käytettiin bakteerikantojen tunnistamisen uudelleen tarkistamiseen.Korkean liman fenotyyppi määritetään "jonotestillä".Kun imipeneemi tai meropeneemi on resistentti, karbapeneemiresistenssi määritetään lääkeherkkyystestillä.Erittäin virulentilla Klebsiella pneumoniaella määritellään korkea liman fenotyyppi (positiivinen merkkijonotestitulos) ja Klebsiella pneumoniae -virulenssiplasmidiin liittyviä kohtia (rmpA2, iutA, iucA)6.
Yksi Klebsiella pneumoniae -pesäke siirrostettiin 5 % lampaanveriagarmaljalle.Kun on inkuboitu yön yli 37 °C:ssa, vedä pesäke varovasti ylös inokulointisilmukalla ja toista 3 kertaa.Jos viskoosi viiva muodostuu kolme kertaa ja pituus on suurempi kuin 5 mm, "viivatesti" katsotaan positiiviseksi ja kannalla on korkea limafenotyyppi.
VITEK-2 kompaktissa automaattisessa mikrobianalysaattorissa (Biomerieux, Marcy L'Etoile, Ranska) antimikrobinen herkkyys useille yleisesti käytetyille antibiooteille havaittiin liemen mikrolaimennuksella.Tulokset tulkitaan Clinical and Laboratory Standards Instituten (CLSI, 2019) kehittämän ohjeasiakirjan mukaisesti.E. coli ATCC 25922 ja Klebsiella pneumoniae ATCC 700603 käytettiin kontrolleina antimikrobisen herkkyyden testaamiseen.
Kaikkien Klebsiella pneumoniae -isolaattien genominen DNA uutettiin TIANamp Bacteria Genomic DNA Kit -sarjalla (Tiangen Biotech Co. Ltd., Peking, Kiina).Laajennetun spektrin β-laktamaasigeenit (blaCTX-M, blaSHV ja blaTEM), karbapenemaasigeenit (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaIMP ja blaOXA-48) ja 9 edustavaa virulenssiin liittyvää geeniä, mukaan lukien pLVPK Plasmidin kaltaiset lokukset (allS, fimH) , mrkD, entB, iutA, rmpA, rmpA2, iucA ja aerobaktiini) monistettiin PCR:llä, kuten aiemmin on kuvattu.13,14 kapseli-serotyyppispesifistä geeniä (K1, K2, K5, K20, K54 ja K57) monistettiin PCR:llä edellä kuvatulla tavalla.14 Jos tulos on negatiivinen, amplifioi ja sekvensoi wzi-lokus määrittääksesi kapselin serotyyppispesifiset geenit.15 Tässä tutkimuksessa käytetyt alukkeet on lueteltu taulukossa S1.Positiiviset PCR-tuotteet sekvensoitiin NextSeq 500 -sekvensointialustalla (Illumina, San Diego, CA, USA).Vertaa nukleotidisekvenssejä suorittamalla BLAST NCBI:n verkkosivustolla (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).
Monipaikkasekvenssityyppitys (MLST) suoritettiin Pasteur Instituten MLST-verkkosivustolla (https://bigsdb.pasteur.fr/klebsiella/klebsiella.html) kuvatulla tavalla.Seitsemän taloudenhoitogeeniä gapA, infB, mdh, pgi, phoE, rpoB ja tonB monistettiin PCR:llä ja sekvensoitiin.Sekvenssityyppi (ST) määritetään vertaamalla sekvensointituloksia MLST-tietokantaan.
Klebsiella pneumoniaen homologia analysoitiin.Klebsiella pneumoniaen genominen DNA uutettiin templaattina, ja ERIC-alukkeet on esitetty taulukossa S1.PCR monistaa genomisen DNA:n ja muodostaa genomisen DNA:n sormenjäljen.16 PCR-tuotetta havaittiin 2 % agaroosigeelielektroforeesilla.DNA-sormenjälkitulokset tunnistettiin käyttämällä QuantityOne-ohjelmiston kaistantunnistusta, ja geneettinen analyysi suoritettiin käyttämällä aritmeettisen keskiarvon painottamatonta pariryhmämenetelmää (UPGMA).Isolaattien, joiden samankaltaisuus on > 75 %, katsotaan olevan sama genotyyppi, ja niiden, joiden samankaltaisuus on < 75 %, katsotaan olevan eri genotyyppejä.
Käytä tilastollista ohjelmistopakettia SPSS for Windows 22.0 tietojen analysointiin.Tiedot on kuvattu keskiarvona ± standardipoikkeama (SD).Kategoriset muuttujat arvioitiin khin neliötestillä tai Fisherin eksaktitestillä.Kaikki tilastolliset testit ovat kaksisuuntaisia, ja P-arvoa <0,05 pidetään tilastollisesti merkitsevänä.
Fudanin yliopistoon kuuluva Shanghain viides kansansairaala keräsi 1 081 Klebsiella pneumoniae -isolaattia 1. tammikuuta 2019 31. joulukuuta 2020 välisenä aikana ja sulki pois kaksoiskappaleet samalta potilaalta.Niistä 392 kantaa (36,3 %) oli hmKP, 341 kantaa (31,5 %) oli CRKP, 39 kantaa (3,6 %) oli CR-hmKP ja 16 kantaa (1,5 %) oli CR-hvKP.On syytä huomata, että CR-hmKP:sta 33,3 % (13/39) ja CR-hvKP:sta 31,2 % (5/16) on vuodelta 2019, 66,7 % (26/39) CR-hmKP:sta ja 68,8 % (11/16) ) CR-hvKP erotettiin vuodelta 2020. Ysköstä (17 kantaa), virtsasta (12 kantaa), poistonestettä (4 kantaa), verestä (2 kantaa), mätä (2 kantaa), sapesta (1 eristys) ja keuhkopussin effuusiota (1 eristys), vastaavasti.Kuusitoista CR-hvKP-tyyppiä saatiin talteen ysköksestä (9 isolaattia), virtsasta (5 isolaattia), verestä (1 isolaatti) ja pleuraeffuusiosta (1 isolaatti).
Kantatunnistuksen, lääkeherkkyystestin, string-testin ja virulenssiin liittyvän geenin havaitsemisen avulla seulottiin 16 CR-hvKP-kantaa.Taulukossa 1 on yhteenveto 16 CR-hvKP-isolaateilla infektoituneen potilaan kliinisistä ominaisuuksista. 16 potilaasta 13 (81,3 %) oli miehiä ja kaikki potilaat olivat yli 62-vuotiaita (keski-ikä: 83,1 ± 10,5 vuotta).He tulivat 8 osastolta ja yli puolet keskus-intensiiviosastolta (9 tapausta).Perussairauksia ovat aivoverenkiertohäiriöt (75 %, 12/16), verenpainetauti (50 %, 8/16), krooninen obstruktiivinen keuhkosairaus (50 %, 8/16) jne. Invasiiviseen kirurgiaan kuuluu mekaaninen ventilaatio (62,5 %, 10/ 16), virtsakatetri (37,5%, 6/16), mahaletku (18,8%, 3/16), leikkaus (12,5%, 2/16) ja suonensisäinen katetri (6,3%, 1/16).Yhdeksän 16 potilaasta kuoli, ja 7 potilasta parani ja heidät kotiutettiin.
39 CR-hmKP-isolaattia jaettiin kahteen ryhmään tahmean nauhan pituuden mukaan.Niistä 20 CR-hmKP-isolaattia, joiden viskoosin nauhan pituus oli ≤ 25 mm, jaettiin yhteen ryhmään ja 19 CR-hmKP-isolaattia, joiden viskoosin nauhan pituus oli > 25 mm, jaettiin toiseen ryhmään.PCR-menetelmä havaitsee virulenssiin liittyvien geenien rmpA, rmpA2, iutA ja iucA positiivisuuden.CR-hmKP-virulenssiin liittyvien geenien positiiviset määrät kahdessa ryhmässä on esitetty taulukossa 2. CR-hmKP-virulenssiin liittyvien geenien positiivisessa määrässä ei ollut tilastollista eroa kahden ryhmän välillä.
Taulukossa 3 on lueteltu 16 lääkkeen yksityiskohtaiset mikrobilääkeresistenssin profiilit.16 CR-hvKP-isolaattia osoitti monilääkeresistenssiä.Kaikki isolaatit käsiteltiin ampisilliinilla, ampisilliini/sulbaktaami, kefoperatsoni/sulbaktaami, piperasilliini/tatsobaktaami, kefatsoliini, kefuroksiimi, keftatsidiimi, keftriaksoni, kefepiimi, kefoksitiini, imipeneemi ja meropeneemi ovat resistenttejä.Trimetopriimisulfametoksatsolilla oli alhaisin vastustuskyky (43,8 %), jota seurasivat amikasiini (62,5 %), gentamysiini (68,8 %) ja siprofloksasiini (87,5 %).
Virulenssiin liittyvien geenien, mikrobilääkeresistenssigeenien, kapselin serotyyppigeenien ja MLST:n jakauma 16 CR-hvKP-isolaatista on esitetty kuvassa 1. Joidenkin virulenssiin liittyvien geenien, mikrobilääkeresistenssigeenien ja kapselin serotyyppigeenien agaroosigeelielektroforeesin tulokset ovat Kuva 1. Kuva 2. MLST-analyysi osoittaa yhteensä 3 ST:tä, ST11 on hallitsevin ST (87,5%, 14/16), jota seuraavat ST23 (6,25%, 1/16) ja ST86 (6,25%, 1). /16).wzi-tyypityksen tulosten mukaan tunnistettiin 4 erilaista kapseliserotyyppiä (kuva 1).16 karbapeneemiresistentin hvKP-isolaatin joukossa K64 on yleisin serotyyppi (n=13), jota seuraavat K1 (n=1), K2 (n=1) ja K47 (n=1).Lisäksi kapselin serotyypin K1 kanta on ST23, kapselin serotyypin K2 kanta on ST86 ja loput 13 K64-kantaa ja 1 K47-kanta ovat kaikki ST11.9 virulenssigeenin positiiviset määrät 16 CR-hvKP-isolaatissa on esitetty kuvassa 1. Virulenssiin liittyvät geenit entB, fimH, rmpA2, iutA ja iucA ovat läsnä 16 CR-hvKP-kannassa, joita seuraa mrkD (n = 14), rmpA (n = 13), aerobakteriiini (n = 2), AllS (n = 1).Kaikki 16 CR-hvKP-isolaattia kantavat karbapenemaasigeenin blaKPC-2 ja laajennetun spektrin β-laktamaasigeenin blaSHV.16 CR-hvKP-isolaatissa ei ollut karbapeneemigeenejä blaNDM, blaVIM, blaIMP, blaOXA-48 ja laajennetun spektrin β-laktamaasigeenejä blaTEM, blaCTX-M-2 ryhmä ja blaCTX-M-8 ryhmä.16 CR-hvKP-kannasta 5 kantaa kantoi laajennetun spektrin β-laktamaasigeenin blaCTX-M-1-ryhmää ja 6 kantaa laajennetun spektrin β-laktamaasigeenin blaCTX-M-9-ryhmää.
Kuva 1 16 CR-hvKP-isolaatin virulenssiin liittyvät geenit, antimikrobinen resistenssigeenit, kapselin serotyyppigeenit ja MLST.
Kuva 2 Joidenkin virulenssiin liittyvien geenien, mikrobilääkeresistenssin geenien ja kapselin serotyyppigeenien agaroosigeelielektroforeesi.
Huomautus: M, DNA-markkeri;1, blaKPC (893 bp);2, entB (400 bp);3, rmpA2 (609 bp);4, rmpA (429 bp);5, iucA (239 bp);6, iutA (880 bp);7, Aerobacterin (556 bp);8, K1 (1283 bp);9, K2 (641 bp);10, kaikki S (508 bp);11, mrkD (340 bp);12, fimH (609 bp).
ERIC-PCR:ää käytettiin analysoimaan 16 CR-hvKP-isolaatin homologiaa.PCR-monistuksen ja agaroosigeelielektroforeesin jälkeen DNA-fragmentteja on 3-9.Sormenjälkitulokset osoittivat, että 16 CR-hvKP-isolaattia olivat erittäin polymorfisia, ja isolaattien välillä oli ilmeisiä eroja (kuva 3).
Viime vuosina CR-hvKP-isolaateista on tullut yhä enemmän raportteja.CR-hvKP-isolaattien ilmaantuminen on suuri uhka kansanterveydelle, koska ne voivat aiheuttaa vakavia, vaikeasti hoidettavia infektioita terveille ihmisille.Tässä tutkimuksessa tutkittiin CR-hvKP:n esiintyvyyttä ja molekyyliepidemiologisia ominaisuuksia Shanghain korkea-asteen sairaalassa vuosina 2019–2020, jotta voidaan arvioida, onko CR-hvKP:n puhkeamisen riskiä ja sen kehityssuuntausta tällä alueella.Samalla tämä tutkimus voi tarjota kattavamman arvion kliinisestä tarttuvuudesta, jolla on suuri merkitys tällaisten isolaattien leviämisen estämisessä.
Tässä tutkimuksessa analysoitiin takautuvasti CR-hvKP:n kliinistä jakautumista ja trendiä vuosina 2019–2020. Vuodesta 2019 vuoteen 2020 CR-hvKP-isolaatit osoittivat kasvavaa trendiä.Noin 31,2 % (5/16) CR-hvKP:sta eristettiin vuonna 2019 ja 68,8 % (11/16) CR-hvKP:sta vuonna 2020, mikä vastaa kirjallisuudessa raportoitua CR-hvKP:n nousutrendiä.Koska Zhang et ai.CR-hvKP kuvattiin ensimmäisen kerran vuonna 2015,10 CR-hvKP-kirjallisuutta on raportoitu yhä enemmän, 17-20 pääasiassa Aasian ja Tyynenmeren alueella, erityisesti Kiinassa.CR-hvKP on superbakteeri, jolla on supervirulenssi ja monilääkeresistenssi.Se on haitallista ihmisten terveydelle ja sillä on korkea kuolleisuus.Siksi on kiinnitettävä huomiota ja ryhdyttävä toimenpiteisiin sen leviämisen estämiseksi.
16 CR-hvKP-isolaatin antibioottiresistenssianalyysi osoitti korkean antibioottiresistenssin asteen.Kaikki isolaatit käsiteltiin ampisilliinilla, ampisilliini/sulbaktaami, kefoperatsoni/sulbaktaami, piperasilliini/tatsobaktaami, kefatsoliini, kefuroksiimi, keftatsidiimi, keftriaksoni, kefepiimi, kefoksitiini, imipeneemi ja meropeneemi ovat resistenttejä.Trimetopriimisulfametoksatsolilla oli alhaisin vastustuskyky (43,8 %), jota seurasivat amikasiini (62,5 %), gentamysiini (68,8 %) ja siprofloksasiini (87,5 %).Lingling Zhanin ja muiden tutkimien CR-hmkp:n vastustuskyky on samanlainen kuin tässä tutkimuksessa [12].CR-hvKP-tartunnan saaneilla potilailla on monia perussairauksia, heikko immuniteetti ja heikko itsenäinen sterilointikyky.Siksi oikea-aikainen hoito antimikrobisen herkkyystestin tulosten perusteella on erittäin tärkeää.Tarvittaessa tartunnan saanut paikka voidaan löytää ja hoitaa kuivauksella, puhdistamalla ja muilla menetelmillä.
39 CR-hmKP-isolaattia jaettiin kahteen ryhmään tahmean nauhan pituuden mukaan.Niistä 20 CR-hmKP-isolaattia, joiden viskoosin nauhan pituus oli ≤ 25 mm, jaettiin yhteen ryhmään ja 19 CR-hmKP-isolaattia, joiden viskoosin nauhan pituus oli > 25 mm, jaettiin toiseen ryhmään.Verrattaessa CR-hmKP-virulenssiin liittyvien geenien positiivisia määriä kahden ryhmän välillä, ei ollut tilastollisesti merkitsevää eroa virulenssigeenien positiivisissa määrissä näiden kahden ryhmän välillä.Lin Ze et ai.osoitti, että Klebsiella pneumoniaen virulenssigeenien positiivinen määrä oli merkittävästi korkeampi kuin klassisen Klebsiella pneumoniaen.21 Kuitenkin, korreloiko virulenssigeenien positiivinen määrä positiivisesti tahmean ketjun pituuden kanssa, on edelleen epäselvää.Muut tutkimukset ovat osoittaneet, että klassinen Klebsiella pneumoniae voi myös olla erittäin virulentti Klebsiella pneumoniae, jolla on korkeampi positiivinen virulenssigeenien määrä.22 Tässä tutkimuksessa havaittiin, että CR-hmKP:n virulenssigeenin positiivinen määrä ei korreloi positiivisesti liman pituuden kanssa.Merkkijono (tai ei kasva tarttuvan merkkijonon pituuden mukaan).
Tämän tutkimuksen ERIC PCR -sormenjäljet ​​ovat polymorfisia, eikä potilaiden välillä ole kliinistä risteytystä, joten 16 potilasta, joilla on CR-hvKP-infektio, ovat satunnaisia ​​tapauksia.Aiemmin useimmat CR-hvKP:n aiheuttamat infektiot on raportoitu yksittäisinä tai satunnaisina tapauksina, 23,24 ja pienimuotoiset CR-hvKP-epidemiat ovat harvinaisia ​​kirjallisuudessa.11,25 ST11 on yleisin ST11 CRKP- ja CR-hvKP-isolaateissa Kiinassa.26,27 Vaikka ST11 CR-hvKP edusti 87,5 % (14/16) 16 CR-hvKP-isolaatista tässä tutkimuksessa, ei voida olettaa, että 14 ST11 CR-hvKP -kantaa ovat samasta kloonista, joten ERIC PCR -sormenjälki vaaditaan.Homologia-analyysi.
Tässä tutkimuksessa kaikille 16 CR-hvKP-tartunnan saaneelle potilaalle tehtiin invasiivinen leikkaus.Raporttien mukaan CR-hvKP11:n aiheuttama ventilaattoriin liittyvän keuhkokuumeen kohtalokas puhkeaminen osoittaa, että invasiiviset toimenpiteet voivat lisätä CR-hvKP-infektion riskiä.Samaan aikaan 16 CR-hvKP-tartunnan saaneella potilaalla on perussairauksia, joista aivoverisuonitaudit ovat yleisimpiä.Aiempi tutkimus osoitti, että aivoverisuonitauti on merkittävä itsenäinen riskitekijä CR-hvKP-infektiolle.28 Syynä ilmiöön voi olla aivoverisuonitautipotilaiden heikentynyt vastustuskyky, patogeenisiä bakteereja ei voida sulkea pois itsenäisesti ja luotetaan vain niiden bakteereja tappavaan vaikutukseen.Antibiootit johtavat pitkällä aikavälillä monilääkeresistenssin ja hypervirulenssin yhdistelmään.16 potilaasta 9 kuoli ja kuolleisuus oli 56,3 % (9/16).Kuolleisuus on korkeampi kuin 10,12 aiemmissa tutkimuksissa ja pienempi kuin 11,21 raportoitu aikaisemmissa tutkimuksissa.16 potilaan keski-ikä oli 83,1±10,5 vuotta, mikä viittaa siihen, että vanhukset ovat alttiimpia CR-hvKP:lle.Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että nuoret ovat alttiimpia infektioille.Klebsiella pneumoniaen virulenssi.29 Muut tutkimukset ovat kuitenkin osoittaneet, että vanhukset ovat alttiita erittäin virulentille Klebsiella pneumoniaelle24,28.Tämä tutkimus on yhdenmukainen tämän kanssa.
16 CR-hvKP-kannasta, yhtä ST23 CR-hvKP:ta ja yhtä ST86 CR-hvKP:ta lukuun ottamatta, muut 14 kantaa ovat kaikki ST11 CR-hvKP.ST23 CR-hvKP:ta vastaava kapseliserotyyppi on K1 ja ST86 CR-HVKP:n vastaava kapseliserotyyppi on K2, kuten aikaisemmat tutkimukset.30-32 ST23 (K1) CR-hvKP:lla tai ST86 (K2) CR-hvKP:lla infektoitunutta potilasta kuoli, ja kuolleisuusaste (100 %) oli merkittävästi korkeampi kuin potilailla, joilla oli ST11 CR-hvKP -infektio (50 %).Kuten kuvassa 1 on esitetty, virulenssiin liittyvien geenien ST23- (K1)- tai ST86- (K2) -kantojen positiivisuusaste on korkeampi kuin ST11 (K64) -kantojen.Kuolleisuus voi liittyä virulenssiin liittyvien geenien positiiviseen määrään.Tässä tutkimuksessa 16 CR-hvKP-kantaa kantavat kaikki karbapenemaasigeenin blaKPC-2 ja laajennetun spektrin β-laktamaasigeenin blaSHV.blaKPC-2 on yleisin karbapenemaasigeeni CR-hvKP:ssa Kiinassa.33 Zhaon et al.:n tutkimuksessa 25blaSHV on laajennetun spektrin β-laktamaasigeeni, jolla on korkein positiivinen määrä.Virulenssigeenit entB, fimH, rmpA2, iutA ja iucA ovat läsnä kaikissa 16 CR-hvKP-isolaatissa, joita seuraavat mrkD (n=14), rmpA (n=13), anaerobisiini (n=2), allS (n =) 1), joka on samanlainen kuin edellinen tutkimus.34 Jotkut tutkimukset ovat osoittaneet, että rmpA ja rmpA2 (liman fenotyyppigeenien modulaattorit) voivat edistää kapselipolysakkaridien erittymistä, mikä johtaa hypermukoidisiin fenotyyppeihin ja lisääntyneeseen virulenssiin.35 Aerobakteriineja koodaa iucABCD-geeni ja niiden homologisia reseptoreita koodaa iutA-geeni, joten niillä on korkeampi virulenssitaso G. mellonella -infektiomäärityksessä.allS on K1-ST23:n markkeri, ei pLVPK:ssa, pLVPK on virulenssiplasmidi K2 supervirulenssityypistä.allS on HTH-tyyppinen transkription aktivaattori.Näiden virulenssigeenien tiedetään edistävän virulenssia ja vastuussa kolonisaatiosta, invaasiosta ja patogeenisyydestä.36
Tämä tutkimus kuvaa CR-hvKP:n esiintyvyyttä ja molekyyliepidemiologiaa Shanghaissa, Kiinassa.Vaikka CR-hvKP:n aiheuttama infektio on satunnaista, se lisääntyy vuosi vuodelta.Tulokset tukevat aiempaa tutkimusta ja osoittavat, että ST11 CR-hvKP on Kiinan suosituin CR-hvKP.ST23 ja ST86 CR-hvKP osoittivat korkeampaa virulenssia kuin ST11 CR-hvKP, vaikka ne molemmat ovat erittäin virulentteja Klebsiella pneumoniae.Kun erittäin virulenttien Klebsiella pneumoniaen prosenttiosuus kasvaa, Klebsiella pneumoniaen vastustuskyky voi laskea, mikä johtaa sokeaan optimismiin kliinisessä käytännössä.Siksi on tarpeen tutkia Klebsiella pneumoniaen virulenssia ja lääkeresistenssiä.
Tämän tutkimuksen hyväksyi Shanghain viidennen kansansairaalan lääketieteen eettinen komitea (nro 104, 2020).Kliiniset näytteet ovat osa rutiinia sairaalan laboratoriotoimenpiteitä.
Kiitos koko Shanghain viidennen kansansairaalan keskuslaboratorion henkilökunnalle tämän tutkimuksen teknisten ohjeiden antamisesta.
Tätä työtä tuki Minhangin alueen luonnontieteiden säätiö, Shanghai (hyväksyntänumero: 2020MHZ039).
1. Navon-Venezia S, Kondratyeva K, Carattoli A. Klebsiella pneumoniae: tärkein globaali antibioottiresistenssin lähde ja sukkula.FEMS Microbiology tarkistettu painos 2017;41(3): 252–275.doi: 10.1093/femsre/fux013
2. Prokesch BC, TeKippe M, Kim J jne. Korkean toksisuuden aiheuttama primaarinen osteomyeliitti.Lancet on saanut Dis-tartunnan.2016;16(9):e190–e195.doi:10.1016/S1473-3099(16)30021-4
3. Shon AS, Bajwa RPS, Russo TA.Korkea virulenssi (superlima).Klebsiella pneumoniae -virulenssi.2014;4(2): 107–118.doi: 10.4161/viru.22718
4. Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae: Jatka hyökkäystä vahvalla puolustuksella.Microbiol Mol Biol Rev. 2016;80(3):629–661.doi:10.1128/MMBR.00078-15
5. Fang C, Chuang Y, Shun C, et ai.Klebsiella pneumoniaen uudet virulenssigeenit, jotka aiheuttavat maksan primaarisen paiseen ja sepsiksen metastaattisia komplikaatioita.J Exp Med.2004;199(5):697–705.doi:10.1084/jem.20030857
6. Russo TA, Olson R, Fang CT jne. J Clin Microbiolin tunnistaminen, biomarkkeri, jota käytetään erottamaan erittäin virulentti Klebsiella pneumoniae klassisesta Klebsiella pneumoniaesta.2018;56(9):e00776.
7. YCL, Cheng DL, Lin CL.Klebsiella pneumoniae -maksaabsessi, joka liittyy tarttuvaan endoftalmiittiin.Arch intern lääkäri.1986; 146(10):1913-1916.doi:10.1001/archinte.1986.00360220057011
8. Chiu C, Lin D, Liaw Y. Metastaattinen septinen endoftalmiitti märkivässä maksapaiseessa.J Kliininen gastroenterologia.1988;10(5):524–527.doi:10.1097/00004836-198810000-00009
9. Guo Yan, Wang Shun, Zhan Li jne. Invasiivisiin infektioihin liittyvien korkean limakalvojen Klebsiella pneumoniae -isolaattien mikrobiologiset ja kliiniset ominaisuudet Kiinassa.Esisolut ovat saastuneet mikro-organismeilla.2017;7.
10. Zhang Yi, Zeng Jie, Liu Wei jne. Erittäin virulentin karbapeneemeille vastustuskykyisen Klebsiella pneumoniae -kannan ilmaantuminen kliinisissä infektioissa Kiinassa [J].J infektio.2015;71(5): 553–560.doi:10.1016/j.jinf.2015.07.010
11. Gu De, Dong Nan, Zheng Zhong jne. ST11-karbapeneemille resistentin korkean virulenssin Klebsiella-keuhkokuumeen kohtalokas puhkeaminen kiinalaisessa sairaalassa: molekyyliepidemiologinen tutkimus.Lancet on saanut Dis-tartunnan.2018;18(1):37–46.doi:10.1016/S1473-3099(17)30489-9
12. Zhan Li, Wang S, Guo Yan, et ai.Karbapeneemille resistentin ST11-hypermukoidi Klebsiella pneumoniae -epidemia korkea-asteen sairaalassa Kiinassa.Esisolut ovat saastuneet mikro-organismeilla.2017;7.
13. FRE, Messai Y, Alouache S jne. Klebsiella pneumoniae -virulenssispektri ja lääkeherkkyysmalli eristetty eri kliinisistä näytteistä[J].Patofysiologia.2013;61(5):209-216.doi:10.1016/j.patbio.2012.10.004
14. Turton JF, Perry C, Elgohari S jne. Klebsiella pneumoniaen PCR-karakterisointi ja tyypitys käyttämällä kapselityyppispesifisyyttä, vaihtelevaa määrää tandemtoistoja ja virulenssigeenikohteita [J].J Med Microbiology.2010;59 (luku 5): 541–547.doi:10.1099/jmm.0.015198-0
15. Brisse S, Passet V, Haugaard AB jne. Wzi-geenisekvensointi, nopea menetelmä Klebsiella-kapselin tyypin määrittämiseen [J].J Kliininen mikrobiologia.2013;51(12):4073-4078.doi:10.1128/JCM.01924-13
16. Ranjbar R, Tabatabaee A, Behzadi P jne. Eri eläinten ulostenäytteistä eristetyt E. coli -kannat, enterobakteerien toistuva geenityypitys konsensuspolymeraasiketjureaktion (ERIC-PCR) genotyypitys [J].Iran J Pathol.2017;12(1): 25–34.doi:10.30699/ijp.2017.21506


Postitusaika: 15.7.2021